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商户单号的作用是：

1.各种支付交易生成的交易号和商户号用于记录交易信息和资金流，通常作为银行和支付平台之间的对账依据，很少被个人使用。

2.在某些特殊情况下，它对个人权利保护或交易信息查询有很大影响。

3.商户号是商户生成的交易序列号，也是一种交易凭证。根据它，可以找到商家的交易记录，并且商家可以凭借这个号码来检查他自己的交易信息。